Первым кандидатом на должность Главы (Башкана) Гагаузии, зарегистрированным местной Центральной избирательной комиссией, стал
Георгий Табунщик, нынешний глава автономии. Табунщик представил подписные листы, содержащие 7381 подписей в свою поддержку, из которых 6811 подписей были признаны действительными, при необходимом минимуме в 5000. Постановление о регистрации было утверждено 6 октября 2006 года.
Позднее, избирательный орган Гагаузии зарегистрировал в качестве кандидата Николая Дудогло, примара города Комрат.
Также были выданы бланки подписных листов для сбора подписей в поддержку кандидатов:
- Михаила Формузала, примара города Чадыр-Лунга, лидера движения «Единая Гагаузия» (9 октября 2006 года инициативная группа по выдвижению М. Формузала представила избирательному органу списки, содержащие 7545 подписей в поддержку кандидата);
- Александр Стояногло, заместитель Генерального прокурора, бывший прокурор Гагаузии;
- Валерий Яниогло, кандидат от Избирательного блока «Patria-Родина — Равноправие»;
- Леонид Добров, лидер движения «Гагауз-Халкы»;
- Дмитрий Чимпоеш, руководитель Фонда поддержки предпринимателей Гагаузии.